Šta je CT-vrijednost i kako se tumači?
5. januar 2021
CT-vrijednost je oznaka, povezana sa testom na koronu, oko koje se uvijek iznova spotičemo. U osnovi, ona pokazuje veličinu virusnog opterećenja u jednom uzorku (brisu). Stručnjaci raspravljaju o tome šta bi to moglo značiti u pogledu stepena infektivnosti pacijenta i toka bolesti.
To nije lako: da bismo zaista razumjeli šta ova vrijednost znači, moramo detaljnije pogledati postupak koji se primjenjuje u PCR-testu.
Kako funkcioniše PCR?
PCR-test se smatra najpouzdanijim načinom za otkrivanje infekcije koronavirusom. PCR je kratica za „Polymerase Chain Reaction" - polimeraznu lančanu reakciju. To je molekularno-biološki proces, koji se koristi za kopiranje dijelova DNK pomoću njenog enzima polimeraze i kasniju analizu.
Očišćeni genetski materijal stavlja se u plastičnu epruvetu sa raznim enzimima i DNK-komponentama: to se naziva PCR-pristup ili PCR-metoda. Epruveta se potom stavlja u „thermocycler" - što je u osnovi kombinacija šporeta i frižidera. Ovaj uređaj može podizati temperaturu u epruveti, onako kako je prethodno programiran. To je važno jer se kopiranje dijelova DNK sastoji od različitih koraka, od kojih se svaki odvija na različitim temperaturama i ponavlja u ciklusima.
Dvostruki lanac DNA se više puta odvaja i dopunjava tako da se DNK udvostručuje u svakom ciklusu. To je manje više sve što se događa tokom normalnog PCR-procesa.
Koje su posebne karakteristike korona-PCR-a?
Korona virus nema DNK, već RNK. Ali to nije problem, jer postoje enzimi koji RNK prepisuju odnosno pretvaraju u DNK. To se dešava u jednom koraku, prije nego što počne PCR. PCR-testovi, u kojima se RNA transkribira u DNK, nazivaju se RT-PCR. Oznaka RT znači „Enzym Reverse Transcriptas", dakle enzim koji RNK pretvara u DNK.
Korona test ima još jednu posebnost. Uobičajeni PCR jednostavno duplicira DNK, a genetski materijal se analizira nakon PCR-a. Za razliku od njega, korona-PCR sadrži fluorescentne sonde. Ove sonde su usmjerene na određeni ciljni gen u virusu. Tek kad se sonda veže za ciljni gen, počinje svijetliti.
Ovaj sjaj se može izmjeriti fotometrom u termičkom ciklusu i očitati na kompjuteru. Na taj način tokom PCR-a možete vidjeti jesu li geni virusa prisutni u uzorku (brisu). To se može vidjeti u stvarnom vremenu. Zbog toga se ovaj oblik PCR-a naziva „real time PCR".
Koliko su pouzdani ovi testovi?
Tačnost PCR testa u Njemačkoj je vrlo visoka. Infekcije se otkrivaju u 98 posto slučajeva. Da bi bili dvostruko sigurniji, većina uzoraka takođe se ispituje sa dva različita ciljna gena, odnosno dvije različite fluorescentne sonde.
Real time PCR (oznaka za real time je q ili r na primjer, RT-qPCR, ponekad i qRT-PCR) je standardni alat za dijagnostikovanje virusa. Koristi se na primjer i za testiranje donirane krvi na viruse HIV-a ili hepatitisa.
Šta je CT?
CT je oznaka za Cycle Threshold, kojim se opisuje broj ciklusa u kojima je izveden real time PCR, prije nego što se mjeri fluorescencija. Taj proces traje duže, što je manje genoma virusa u plastičnoj epruveti na početku PCR-a. Visoka CT vrijednost stoga ukazuje na nisko virusno opterećenje uzorka.
- pročitajte i ovo: Koronavirus: 120 milijuna antigen-testova za siromašne zemlje
Šta utiče na CT vrijednost?
Nažalost, visoka vrijednost CT-a ne znači izravno nizak rizik od infekcije drugih ljudi. To je zbog različitih faktora, poput
• nedostatka standardizacije
Ne postoji jedinstvena, standardizovana vrijednost CT-, kojom se osoba koja je pozitivno testirana, više ne smatra infektivnom. Jedan od razloga je taj što postoji mnogo različitih testova koji su usmjereni na različite ciljne gene i čije se PCR-metode pomalo razlikuje. Time se također pravi razlika po pitanju koja količina virusa dovodi do određene vrijednosti CT-a.
Studije Instituta Robert Koch pokazale su da se korona virusi sa CT-vrijednošću 30 više ne mogu reproducirati u laboratoriji. Ovo takođe govori da ne postoji rizik da se zarazite od osobe od koje potiče uzorak dat na analizu. Studije u Velikoj Britaniji pokazale su, međutim, da se čak i sa CT-vrijednošću većom od 35, osam posto uzoraka u laboratoriji i dalje može reproducirati. To znači da bi osobe sa tom CT-vrijednošću i dalje mogle biti zarazne.
Zanimljivo je da čak i isti test može dati različite rezultate u različitim laboratorijama. Dakle, ne postoji jasna CT-vrijednost iz koje se može izvući zaključak da je osoba pozitivna na koronu, ali ne i zarazna.
・ Tok bolesti
Pogotovo na početku bolesti izazvane koronom, virusno opterećenje osobe i dalje može biti vrlo malo. Svako, ko na početku infekcije napravi test koji ima visoku CT-vrijednost, nekoliko dana kasnije može biti jako zarazan. Rezultat PCR-testa stoga treba uvijek posmatrati zajedno s mogućim simptomima. Kontakti sa ljudima koji su više izloženi riziku zaraze ili boravak u rizičnim područjima takođe igraju ulogu u tumačenju testa.
・ Virusno opterećenje u uzorku ne odražava nužno virusno opterećenje pacijenta
Visoka CT-vrijednost znači da je ispitivani uzorak (bris) sadržavao malo virusa. Međutim, to ne znači da sam pacijent ima nisko virusno opterećenje. Mnogi faktori mogu uticati na količinu virusa u uzorku. Na primjer, kako je uzet bris, koliko je uzeto uzoraka, kako je uzorak pohranjen i transpovan. Postoje i fluktuacije u zavisnosti od toga sa kojeg mjesta u nosu i ustima je uzet bris. Zaključak: Vrijednost CT-a ne govori ništa pouzdano o tome koliko je neko zarazan. Međutim, važan je pokazatelj kada liječnik tumači nalaze.